去日本旅游最便宜的时间是 每年的六月份。在这期间，由于学生尚未放暑假，旅游高峰尚未到来，机票和住宿价格相对较低。此外，六月份没有特别受欢迎的旅游热点，使得游客可以更轻松地安排行程，避免拥挤的旅游景点，从而节省费用。

综合以上信息，六月份去日本旅游不仅可以享受较为低廉的旅游成本，还能避开旅游高峰期的种种不便。因此，对于预算有限或希望获得更舒适旅行体验的游客来说，六月份是去日本旅游的最佳时期。